新型コロナウイルスSARS-CoV-2のゲノム分子疫学調査（2020年10月26日現在）

新型コロナウイルスSARS-CoV-2のゲノム分子疫学調査（2020年10月26日現在）

新型コロナウイルス・ゲノム分子疫学解析によるクラスター対策

2019年末に中国・武漢で初めて確認された新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）は、2020年１月に国内で初めて感染者が確認された。その後、現在まで地域的な感染クラスター（集団）とその集合体である複数回の感染ピークを生じている。自治体では積極的疫学調査を実施し、クラスターの発生源の特定と濃厚接触者の追跡によって感染拡大を封じ込める対策を行ってきた。この活動を支援すべく、我々は、SARS-CoV-2（一本鎖プラス鎖RNAウイルス、全長29.9 kb）のゲノム配列を確定し、感染クラスターに特有な遺伝子情報およびクラスター間の共通性を解析している。これまでに2回にわたってゲノム情報が示す国内伝播の状況を概説してきた（2020年4月27日^1）、2020年8月6日^2））。また、日本国内^3,4）、ダイヤモンド・プリセンス号の乗員乗客^5）、空港検疫所の陽性検体^6）より確定されたSARS-CoV-2ゲノム配列の解析については学術誌にて参照可能である。